政治研究所
所長:陳先才 副所長:唐樺
經濟研究所
所長:王華 副所長:王勇
歷史研究所
所長:陳忠純 副所長:黃俊凌
文學研究所
所長:蔣小波 副所長:劉奎
法律研究所
所長:季燁 副所長:劉文戈
兩岸關系研究所
所長:張寶蓉 副所長:肖日葵
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民進黨研究中心
主任:陳先才 副主任:王貞威
兩岸青年研究中心
主任:張寶蓉 副主任:唐樺 林子榮
涉臺外交研究中心
主任:季燁
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兩岸融合發展與國家統一政策模擬實驗室
主任:陳先才 副主任:王華 葉宏明
大數據與民意調查研究中心
主任:王華 副主任:葉宏明 肖日葵
文獻信息中心
主任:葉宏明 副主任:張華姿
《臺灣研究集刊》編輯部
主編:陳小沖 常務副主編:唐樺
副主編:石正方
編輯部主任:陳勤奮
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院辦公室
主任:陳玉 副主任:黃濤 陳勤奮
繼續教育中心
主任:張羽 副主任:陳玉 黃濤
臺灣研究院院友會
秘書長:張文生 副秘書長:張華姿 黃濤